与国内物流相比，跨境物流除具备其共性外，还伴随国际性等特点，涉及范围更大、影响更深远，跨境物流不仅与多个国家的社会经济活动紧密相连，更受多个国家间多方面、多因素的影响。物流硬件环境与软件环境存在国家差异，不同国家其标准也不同，国内物流、国际物流与目的国物流在衔接上会存在障碍导致顺畅的跨境物流系统难以构建。
物流环境的差异，导致在跨境物流、运输与配送过程中，需要面对不同的法律、文化、习俗、观念、语言、技术、设施等增加了跨境物流的运作难度和系统复杂性。此外，如关税、非关税壁垒、物流成本、空间距离等，都直接或间接地影响、制约跨境物流。
目前，我国跨境物流还停留在传统的商品运输、配送、货代等层面，物流高端服务与增值服务缺失，无法提供物流系统集成、供应链优化解决方案、大数据物流、云计算信息平台、跨境物流金融、海外即时送等服务，此外，国内物流国际物流与目的国物流在衔接、可视化、信息透明度等方面表现较差，影响并降低了顾客对跨境物流的满意度。
